以掠其财，一时扰得民心惶惶，百姓无法安居乐业，因他踪迹不定，官府也无可奈何。一日，有一手下被官府捕获，在审问时，他竟诬指平日与他意见不合，在南市经商者20余人为同伙，官府将这批商人捉拿归案，不分青红皂白就动之以大刑，因受刑不过，这20余人只得屈认为盗寇。该案报送大理寺裁决，龚永吉仔细阅卷分析，疑窦顿生：既是经商之人，怎会来去无踪，他遂传令将这20余人移送大理寺审问。经过详细审察，终使这20余人的冤狱得以平反，在释放这一天，这20余人竟三步一拜口呼“龚青天”，向龚永吉叩头调恩，被京城人一直传为美谈，由于龚永古的秉公执法，雪冤存活者逾百人。
龚永吉年近七十，有归老之意，但数次奏请告老还乡均未获准，龚永吉再次上疏恳求还乡，终于获准，还乡之日，文武百官具来送行，见龚永吉行李简肃，无不啧啧称善。龚永吉还乡后，在城南崇德里置马塘造屋数间，以耕读为业，过起厂隐居生活，他虽已古稀之年，仍关心乡里，诲人不倦，谦恭待人，对公益事业总是慷慨解囊。离他家五十步地名南井处，有一溪流。洪武年间，龚永吉叔父龚寿捐资建桥一座，因被洪水所毁，行人倍感不便，龚永吉回家后即捐资予以重建。
距家三里许的义乌江畔下埠头处，原有浮桥一座。经年失修，残缺不全。一到春季，洪水泛滥，过往者时有被溺；一到冬季，水结成冰，行人根本无法涉水。龚永吉又带头捐资修造舟楫，致使浮桥恢复如新。龚永吉回乡后，从不以自己曾做过高官而自居，待人接物一视同仁，虽属贫穷潦倒者，乃至农夫、牧童均以诚相待。在他当官时，闻知故乡发生灾荒，即命家人开仓赈济，救活乡民无数。龚永吉因病殁于家，享年73岁，朝廷闻讯，派员为之以三品式营葬，并制“秋水图”一幅以诗赐之。