石邦宪，字希尹，号南溪，又号南塘，贵州清平卫人，明朝名将，屡次平定苗乱有功，官至右都督，卒赠左都督。
苗人龙许保、吴黑苗反叛，总督张岳提议征讨他们，而敌贼攻陷印江、石阡，石邦宪被坐罪逮问，张岳因为铜仁是敌贼的巢穴，而石邦宪有勇有谋，于是上奏留用石邦宪。
石邦宪，于是与川、湖之兵共进贵州，攻破苗砦十分之五，躲藏在山中竹林子里的人，被搜杀殆尽。上功，石邦宪居第一，未及叙功，而龙许保等人突入到思州，捉住知府李允简而去。石邦宪紧急半路拦击，将李允简夺回来了，石邦宪被停止俸禄，让他戴罪立功。
敌贼攻破思州后，又纠集余党，与湖广蜡尔山苗人会合，攻打石阡不克，经过省溪而去，千户安大朝等人半路拦击他们，俘歼敌人大半，夺下敌贼的全部辎重，敌人溃不成军。石邦宪让使者重金收买老谷、老犭革等人擒住龙许保送到军门，而黑苗如过去一样躲藏。又用计重金收买乌朗土官田兴邦等人斩黑苗，敌贼于是被平定，晋升署都督佥事，充任总兵官，代沈希仪镇守贵州。
台黎砦苗人关保倡导作乱，四川容山、广西洪江诸苗响应，远近骚然，朝廷上是安抚还是剿歼不能定下来。石邦宪与湖广分兵讨破他们，传檄十八砦，许他们捉拿首恶赎罪，诸苗听从安抚，设盟受约而回去。播州宣慰使杨烈杀长官王黼，王黼的同党李保等人治兵相攻快有十年，总督冯岳与石邦宪讨平他们。
真州苗人卢阿项作乱，石邦宪用兵七千人编筏渡江，直抵磨子崖，估计敌贼必定来进行夜袭，预先防备。敌贼到达后，被他们击败。敌贼向播州吴鲲求援。诸将感到恐惧，石邦宪说：“水西宣慰使安万铨，是播州所畏怕的。我调水西之兵攻乌江，声讨杨烈纵吴鲲助叛逆之罪，杨烈哪有空暇救人呢？”之后，水西之兵到达。石邦宪进逼敌人的巢穴，乘风放火，斩关而登，敌贼大崩溃，擒住敌贼首领父子，歼俘四百七十多人，石邦宪晋署都督同知。
石邦宪攻破地隆阡叛苗四砦，又攻破答千诸砦，擒住他们的巨魁。地隆阡派遣敌贼龙老三、龙得奎勾结龙停苗人老夭、扳凳苗人石章保等人纵兵抢掠，捉拿石耶洞土官的妻子冉氏带回去，攻击梅平砦。官军要擒拿龙老三。龙得奎走脱幸免，又与老夭等人攻破平南营囤。石邦宪侦察得知冉氏在老夭那里，表面议说要赎她，而暗中击杀老夭。官军于是进入龙停砦，一并捉拿扳凳砦苗人龙老丙，命令他献出石章保。由此诸苗全部被降服。白洗、养鹅的诸苗反叛，石邦宪征讨并