将行署。迁威远营到蛮莫驻扎。蛮莫设置安抚使，因为土官思顺有功，特地把这个官职授予他，刘綎不仅要了思顺很多钱，还放纵部将谢世禄等人奸淫暴虐其妻妹，使思顺情甚不堪，于是思顺非常怨恨他，仓皇出奔缅甸。
刘綎手下有很多其父的老部将，都是强健贤能之人，因此刘綎自认为很强大，出征缅甸战役，统兵金沙江畔，把将台修筑在王骥的旧址上，的确很有威名。然而他为人贪财，驾御部下又不得法，部队回到腾冲时，穿着铠甲大声喧哗，焚烧老百姓的房屋。刘綎在蛮莫听到这消息立即飞马赶到，用金钱犒赏士兵，这才安定下来，而土官思顺害怕祸及自己，叛变投靠了莽姓土匪头子。因此，万历皇帝下诏解除刘綎职务，以游击的身份听候调遣。
不久，罗雄知州者继荣杀死生父者浚，在和尚王道、张道的怂恿下纠结了一帮党徒并用符术训练士兵。者继荣派他的党徒四处抢劫、作乱，巡抚刘世曾派遣刘綎和裨将刘绍桂、万鏊分路讨伐敌人，刘綎连克三城，成功平定罗雄之乱。刘綎平乱后，有人说他私藏财宝，不记他的功劳，刘世曾为他辩白，于是赏赐给他白金，不久起用担任广西参将，移居四川。
刘綎被授职为五军三营参将，正巧碰上丰臣秀吉政府侵略朝鲜，于是刘綎请求让他率领五千名四川兵前去支援，万历皇帝下诏让其以副总兵身份出征。刘綎到达朝鲜时，倭寇已经放弃王京逃走了，刘綎直奔尚州乌岭，乌岭绵延七十里，悬崖峭壁只有一条路可通，倭寇凭借天险，负隅顽抗。别将查大受、祖承训等人插小路翻过槐山，出其不意地出现在乌岭背后，倭寇非常惊恐，于是移兵驻扎釜山浦。刘綎和祖承训等人进兵屯驻大丘、忠州，用全罗水军在釜山海口布防，朝鲜局势基本平定。不久，李如松令刘綎屯兵陕川，防范敌人进攻，取得一定胜利。日军于是将朝鲜王子送回，明神宗令明军大部队撤归，只留下刘綎和吴惟忠一共七千六百人，分别扼守各军事要地，后在总督顾养谦极力主张下，刘綎二人先后回国。
播州土著首领杨应龙叛乱后，明政府提拔刘綎为四川总兵官，但是刘綎企图让朝廷勘验功绩破格提拔，于是贿赂御史宋兴祖，宋兴祖把这事报告了上面，按法律应该革职。吏部讨论以为刘綎功劳较多，请求全部革除在云南时加封的官阶，以副总兵的职位镇守四川，刚好杨应龙又请和了，青海盗匪又猖獗起来，于是特地设置临洮总兵官，调刘綎担任。
第二次朝鲜战争爆发，万历帝下诏刘綎担任防御倭寇的总兵官，提督汉人土著士兵前往讨伐。