康居，环水而国以百数，则统于押蕃舶使焉。”
这里便已明确指出流求在内的澎湖、台湾，都属于岭南节度使管辖范围。
不过，这里的管辖更倾向于羁糜附属，并不进行实际意义上的管理。
这种对台湾、澎湖的羁糜关系，-直从唐朝延续到了两宋，在北宋年间的台湾甚至还出现了许多“宋钱”，有太平、至道、元佑、天禧等年号。
宋徽宗时期有个泉州知州陆藻，专门作了一篇《泉州修城记》说：“泉州距京师五十有四驿站，连海外之国三十有六岛。”
这里的“海外之国三十有六岛”就是说的台湾、澎湖两片，而“连”的意思就是指代行政隶属的关系，即徽宗年间的泉州行政区划，是包括了“三十六岛”的澎湖以及台湾附属的。
到了南宋偏安江南，民间百姓大量外逃迁居澎湖、台湾两地，南宋朝廷为了方便管理，也为了抽成赋税、粉饰太平，正式将澎湖划归福建路晋江县管辖。
元朝灭宋，大量不愿屈服的汉民南逃海外，前往澎湖定居移民。因为移民澎湖的汉人太多，他们甚至在岛上建立了村寨，并种植胡麻、绿豆，还放牧山羊，形成了传统的男耕渔牧与女子纺织的聚落式社会，同时又往台湾进一步移民。
到了至元二十八年，由于百姓大规模移民海外，为了加强对百姓的管理，元朝派遣杨祥为宣慰使、吴志斗为礼部员外郎、阮鉴为兵部员外郎，对台湾进行了第一次试探性招抚。
只不过，由于对台湾并不熟悉，招抚船队来到了土著部落的聚居点，双方因语言不通而发生冲突。
最络，元军被杀了人，作为副手之一-的吴志斗“失踪”，元军被迫返航。
过了六年后，元廷才再度派兵招抚，这一次终于成功（因为带了一万五千军队）。
为了方便管理招抚后的台湾，元朝在澎湖诸岛设置巡检司，仍隶属于福建晋江县，专管巡逻澎湖和查缉罪犯，以及兼办澎湖盐课。
澎湖巡检司的设立，算是中原王朝对澎湖诸岛首次真正意义上的行政管理，而非唐宋以来的羁縻附属。
大明立国初期，也继承了澎湖巡检司的建制，但在随后出于海防与倭寇的问题，又在洪武二十年正式撤销澎湖巡检司，并将澎湖岛民尽数迁居福建漳、泉二州。
但明朝的禁海迁界政策实际并没有什么卵用，还是有许多内地百姓，尤以同安、漳州百姓，为了逃避沉苛赋税，而陆续逃避澎湖。
时至今日，已