一指，初露锋芒。
朱元璋得金陵，以军食供应不足，知府王宗显请求增加田租，老百姓非常反感此事，李文忠知道后，上书请求减少百姓田租额度，朱元璋欣然批准同意。至正二十七年李文忠上书舅舅，请求将母亲“乞归改葬”，得到允许，将母亲之坟还“葬于先陇”“盱眙县灵迹乡冷水涧之原”，然后还军。洪武三年，李文忠打败元将杨思祖，俘获了杨思祖的部众一万六千余人，六月二十日，以平定沙漠诏告天下，元朝残余势力受到沉重打击，这一役意义重大，有力地稳定了新生的明朝政权。
李文忠到京城奉献捷报，太祖朱元璋御临奉天门接受大臣使节的朝贺，并随即将李文忠获胜消息书谕李贞，殷切教诲李文忠：“今年正月，保儿帅帅师北征，大获胜利，勇冠三军，威镇塞外。在朕欢欣，于贞可贺。然今既回京，速遣还家省侍，贞当更加多训。勿作非为使满朝称善，岂不伟欤？临书诚祝，想宜知悉。”六月，李文忠返乡，四处寻访，多方打听，在泗州盱眙县寻找到早已失散离世的朱元璋长姐及姐夫王七一的灵榇，因其衣衾棺槨，改葬于本县太平乡段家庄，返回朝廷后据实以告，得知长期音信全无的长姐及姐夫下落，太祖感慨万端，唏嘘不已，六月九日下诏，追封长姐为太原长公主，夫王七一为驸马都尉，同时追封李文忠母亲为陇西长公主。
太祖为了朝夕都能见到李贞，就赐第于皇城西华门外之津桥，诏李贞住进赐第，太祖经常驾临李府赐宴，太子诸王时往起居，皇亲当中受到如此重视的，没有第二个人能与他相比，令李贞感激不尽，李贞晚年尤折节谦抑，曾说：“富贵而忘贫贱，君子不为也。”
李文忠解除兵权，闲居家中后，为人恭敬谨慎，在家一论兵法，如数家珍，侃侃而谈，宛如一位儒者，太祖十分偏爱他看重他，但是朱元璋对李文忠爱恨交加，在他看来，李文忠的文韬武略是一个隐患，因此总对他怀有戒心。他对待李文忠的做法和李善长一样，给他们很高的荣誉但是不给实权，他让李文忠掌管大都督府兼领国子监，似乎是发挥了他文武双修的长处，实际上只让他盖房子。
朱元璋一直严禁统兵将领蓄养幕僚，在朱元璋看来，蓄门客和收养义子都是心有大志的表现，而李文忠偏有此好。在浙江时，他用了很多文士作幕僚，杨宪向朱元璋告发，朱元璋一怒之下借故杀了李文忠的幕僚，并将其痛斥一顿。但是李文忠并没有吸取教训，在统一全国的战争中，李文忠无所事事，但他却在行军的路程中收养了不少孤儿，史称“命军中收养道上弃