为军队践行,孙峻看到吕据率领的军队部伍整齐,心生厌恶,借口心口疼痛离去,当夜做梦被诸葛恪的冤魂用剑击中,惊惧发病而死,后事托付给堂弟孙綝。孙綝被吴景帝孙休诛杀后,孙峻的坟墓被刨开,殉葬的印章绶带被没收,棺椁被削薄后重新安葬,孙休又耻于与孙峻、孙綝同族,将二人族籍从族谱中削除,称之为“故峻、故綝”。
孙峻在铲除权臣诸葛恪之后,本应当有一番于国于民有利的作为,可惜在他的执政下,吴国不但未有一番新气象,反而进一步衰弱。