，作为当地官员的山东巡抚梁梦龙一直积极主张实行海运的。他认为：“河漕似安而多劳费，海运似险而属便利，一任其劳，一任其便，相济之策”，当以海运羽翼漕运。所以他不失时机地上疏道：“献悞执元人废渠为海运故道，不知渠身太长，春夏泉涸无所引注，秋冬暴涨无可泄蓄，南北海沙易塞，舟行滞而不通。”在反对声中，开胶莱河报罢，在梁梦龙及其他主张海运的官员的积极建议下，明政府最终同意试行海运，命量拨近地粮十二万石试行。
受命后，梁梦龙派遣指挥王惟精等人进行了多次的试行海运活动，就便进行探访和勘察。此外，梁梦龙还下令，沿海地方不拘军民人等，如有情愿将自己或收买杂粮、用自己船只装载、自胶州海口起至天津籴卖者，均给予执照，并且如果是良民，则重加犒赏，如果是有罪之人，则允许通过试行海运来赎罪。在梁梦龙的鼓励下，先后有多人主动试行海运，海道勘查工作得以顺利进行。由于梁梦龙的积极努力，终于对海道的口岸、日程、里数等有了甚多的了解。
他随即向朝廷上疏，建议正式实行海运，并指出：“以河道为正运，益加综理，以海为备运，兼为规复……再照海防至重，沿海卫所疲顽岁久……今行海运，兼饬海防，是不但有俾于国计，兼有俾于地方。”梁梦龙迁右副都御史改抚河南，海运之事便由王宗沐督行，而后海运成功，梁梦龙受赐白金文绮，加俸一级。由此，恢复了南起淮安至胶州，北自海仓口至天津共三千二百余里的运粮海道，堪分漕运之半，为国家利甚巨。海运船队行至即墨福山岛，遇大风，坏运粮船七艘，漂米数千石，溺军丁十五人，给事、御史交章论其失，海运遂罢而不复行。
隆庆海运所延续的时间并不长，涉及的范围也不甚广，但仍具积极意义。第一，明朝海运主要是为了供给北京以及辽东军饷，海运相对运河漕运，效率高、费用少，能及时有效地实现供给。这次海运，暂时缓解了其时黄河屡次决口河漕难行从而摆在明政府眼前的最急迫的问题，达到了其最初目的；第二，实行海运进一步沟通了南北方联系，为南北海上贸易奠定了基础，促进了山东、京津等地方区域经济的发展；第三，当时山东等地海防久弛，实行海运的同时连带加强了海防。
在试行海运的同时，还著做了《海运新考》，此书“论海道曲折颇为详备”，将实行隆庆海运前前后后的奏疏、疏议、奏记、考说辑在一起，其内容包括了：“海道总图”“咨访海道”“试行海运”“海道蠡测”“海道捷径”“海道口岸”“海道里数