军队，正好与司马师的军队在许昌会合。司马师问王基：“您看毌丘俭等会怎么样呢”王基说：“淮南叛乱，不是当地吏民作乱，而是受到毌丘俭的威胁，怕眼前被杀，所以随大流罢了。如果大兵压境，他们必然土崩瓦解。毌丘俭、文钦的尸首不久就会悬在军门。”司马师说：“说得好”于是派王基打先锋。很多人认为，毌丘俭、文钦勇猛无敌，很难与他们争胜。朝廷下诏让王基停止进军。
王基认为：“毌丘俭等军队完全可以长驱直入，但其仍不进军，说明已露出诈伪的马脚，民众之心有所疑。我们这时候不赶紧声张威势，满足百姓的愿望，反而停军不前，修筑高垒，无异于显示我们的怯懦，这决不合用兵的道理。如果他们抢劫民众，并把各州郡兵士家属也抓来，则我们更丧失民心。为毌丘俭所威胁的人，觉得自己罪责深重，不敢再逃出。这里是乌合之众聚集之地，士兵并无战斗力，却可能成为奸宄之辈得势的温床。如果东吴军队趁机出兵，那淮南大片国土就该被敌人占据了。此后，谯、沛、汝、豫等地就日益危险，这是最大的失策。应快速占据南顿，南顿有大粮仓，足够军队吃上四十天的。驻守南顿坚城，借助大粮仓供应，造成先声夺人的气势，这是平定叛贼的首要措施。”王基反复请战，朝廷才让他占据濦水。抵达后，王基又上书说：“兵贵神速，不能拖延。而今外有强敌，内有叛臣，如果再不当机立断，将来后果就难以预知了。很多人认为指挥军队应持重一些。持重当然应该，但是停军不进就错了。持重决不是指按兵不动呵如果能进军，就不可战胜。而今占据城关，壁垒森严，那边积蓄的粮食提供给敌人，而我们却要远道运粮，这是大错的呵”
司马师想等各路军队到齐后再发兵，还是不听王基的劝谏，王基又说：“将军在外，君主的命令可以不接受。敌人得城，敌人得利。我得城，对我有利。这才叫争城，进军南顿城”于是挥师占据南顿。毌丘俭等从项地发兵也想争夺南顿，走了十来里，听说王基已捷足先登，只好退回项地，当时兖州刺史邓艾屯兵乐嘉，毌丘俭派文钦率兵袭击邓艾。王基知道他们已分散了兵力，就率兵攻项地，毌丘俭失败。淮南二叛平定后，王基任镇南将军、都督豫州诸军事，领豫州刺史，晋封安乐乡侯。他上疏要求分自己的封邑二百户，给叔父王翁的儿子王乔，并求赐王乔关内侯，用来报答王翁的养育之恩，朝廷特许。
征东大将军诸葛诞在淮南起兵反司马氏，王基以豫州刺史身份行镇东将军，都督扬州、豫州军事，当时大军在项地，认为淮南军精良