黄尊素，初名则灿，字真长，号白安，一作白庵，浙江省余姚县人，著名学者黄宗羲之父。力陈时政十失，忤魏忠贤，被夺俸一年，后又上疏论事，再忤魏忠贤意，被削籍归。不久，被逮入都下诏狱，遂自尽。与同为阉党所害的高攀龙、周起元、缪昌期、周顺昌、周宗建、李应升并称“后七君子”，与汪文言并为“东林党的两大智囊”。
黄尊素，任命为宁国推官，精敏强干，提拔御史，请假回家。第二年冬天回到朝廷，上疏请求召回余懋衡、曹于汴、刘宗周、周洪谟、王纪、邹元标、冯从吾，而弹劾尚书赵秉忠、侍郎牛应元、通政丁启睿愚蠢迟钝，赵秉忠、牛应元都辞职离开了。
山东起义被镇压后，起义军余部又煽动起来，巡抚王惟俭无法控制，黄尊素上疏议论说：“巡抚本来是从内外选拔任用的，如今都任用京官，不如推举任用训练有素的地方官员。”又多次陈述边防事务，极力诋毁大将马世龙，违背了枢辅孙承宗的意图。这时皇帝即位已有好几个年头了，从没有召见过大臣，黄尊素请求恢复在便殿面对面召见大臣的先例，当面决定国家大事，否则也可利用讲解经史的机会，让大臣们面对面商讨可不可以执行，皇帝没有采纳。
大风吹起黄沙，昏天蔽日，还伴有敲鼓一般的响声，一连十天都是如此，京师发生三次地震，乾清宫震动得尤其厉害。正好皇帝身体欠佳，人心惶惶不可终日，黄尊素极力陈述时事政策的十大过失，最后说：“陛下压制轻视言官，使人人都有所忌讳，这才有人只提些皮毛小事，不敢冒犯当权者。如今近臣重过赵娆，禁旅与唐末相近，萧墙之祸患比敌国还惨。朝廷没有运筹帷幄的大臣，边防没有制敌取胜的将领。掌权的人对国家的安危愚昧无知，捣乱的人对于失败的局面多方掩饰。不在此时举荐贤才斥退不肖之人，反而厌恶刚毅正直的人，把他看作仇敌，陛下难道就不为国家考虑吗？”奏疏递入，魏忠贤大怒，图谋将他处廷杖刑，韩爌大力营救，于是只剥夺一年俸禄。
不久，杨涟弹劾魏忠贤，被下旨责备，黄尊素很愤怒，接着上疏说：“天下有政权归于近旁宠幸之人，皇帝大权旁落，而国家太平英明的吗？天下有中外纷扰，没有不想从瓜分国家得到一份好处，而还能将国家交给左右的人吗？陛下一定以为曲意奉承，小心谨慎的人可以重用，不知道不远离这些人，就不能使无所畏忌的人得到任用。陛下一定认为只有我才能驾驭，不知道不能驾驭时，则已不可收拾了。陛下自登基以来，公卿台谏一个接一个地被罢免回家，使得在位的